ChemSpider es una de las más extensas y completas bases de datos de estructuras químicas disponibles hoy en día. Con información sobre más de 65 millones de estructuras químicas, ChemSpider es una herramienta invaluable para investigadores, estudiantes y entusiastas de la química. La base de datos es de acceso público y puede ser consultada de manera gratuita en ChemSpider.com, un sitio web publicado por la Royal Society of Chemistry (RSC).
Historia de ChemSpider
ChemSpider fue adquirido por la Royal Society of Chemistry en mayo de 2009. Antes de esta adquisición, ChemSpider estaba bajo el control de ChemZoo Inc., una empresa privada. La plataforma fue lanzada inicialmente en marzo de 2007 como una versión beta. Desde entonces, ha evolucionado y crecido significativamente, consolidándose como una fuente esencial de información química.
Sostenibilidad de ChemSpider
ChemSpider.com se mantiene como un servicio independiente que no depende de subvenciones directas ni de financiamiento para investigaciones. La Royal Society of Chemistry asegura la operatividad del sitio web con los excedentes generados por sus actividades editoriales, lo que permite ofrecer un servicio confiable y sostenible. Además, se generan ingresos a través de la publicidad y de la provisión de servicios web de pago, como las API, para usuarios no académicos. Estas fuentes de ingresos son cruciales para cubrir los costos del servidor, las horas de trabajo del personal y el desarrollo continuo de la plataforma.
Gracias a este modelo de sostenibilidad, ChemSpider está disponible gratuitamente para cualquier persona en el mundo. En 2017, la plataforma alcanzó más de seis millones de usuarios únicos. Estos usuarios incluyen desde estudiantes que buscan ayuda para sus tareas hasta investigadores académicos e industriales, así como usuarios generales interesados en mantener sus conocimientos químicos al día. Los usuarios provienen de todos los continentes, exceptuando la Antártida, y de casi todos los países del mundo.
Contenido de ChemSpider
Los datos en ChemSpider provienen de una amplia comunidad de ciencias químicas: investigadores, bases de datos, editores, proveedores de productos químicos, y muchos más.
Criterios de Inclusión
Los datos en ChemSpider deben cumplir con dos criterios principales para ser incluidos:
- Legibilidad Mecánica: Los depositantes deben proporcionar estructuras en un formato legible por máquina, típicamente un archivo .mol interpretable por InChI, el algoritmo de representación de estructuras químicas de código abierto. Esto permite una representación precisa de moléculas pequeñas con estructuras definidas. En ChemSpider, «pequeñas» se refiere a estructuras de hasta 4000 daltons, incluyendo péptidos cortos, oligonucleótidos y otras estructuras. Las proteínas grandes, redes cristalinas extendidas o nucleótidos largos no son aptos para ChemSpider, pero se pueden encontrar en otras bases de datos más adecuadas para moléculas grandes. Además, sólo se aceptan estructuras definidas, es decir, compuestos con longitudes de cadena exactas, grupos funcionales completamente expresados y órdenes de enlace enteros, debido a la necesidad de describir cada átomo pesado de una molécula. Esto garantiza que se genere un InChI válido.
- Estado Físico: En su mayoría, las estructuras en ChemSpider son moléculas orgánicas, aunque también se aceptan algunos compuestos inorgánicos y organometálicos, curados mediante métodos específicos. Se acepta únicamente compuestos que hayan sido sintetizados o aislados en forma física. Esto excluye estados de transición, compuestos predichos teóricamente, compuestos virtuales de proveedores o compuestos predichos de patentes.
Fuentes de Datos
ChemSpider recibe información de cerca de 250 fuentes de datos únicas. Estas fuentes incluyen datos de proveedores de productos químicos, bases de datos especializadas, individuos, grupos de investigación y editores. Las fuentes abarcan diversas áreas de las ciencias químicas: bioquímica, farmacología y toxicología, productos naturales, espectroscopia y cristalografía. Cada registro en ChemSpider incluye enlaces a todas las fuentes de datos del compuesto, permitiendo a los usuarios verificar y rastrear la procedencia de la información.
La lista de fuentes de datos en ChemSpider está en constante cambio, ya que se agregan nuevas fuentes y se eliminan aquellas obsoletas o de baja calidad. ChemSpider utiliza datos directamente de las fuentes originales, lo que asegura mayor certeza sobre la exactitud y procedencia de los datos. El equipo de ChemSpider trabaja continuamente para preservar los datos heredados que aún están en la plataforma. Ejemplos como el caso de Chessboardane han llevado al equipo a ser cauteloso con la aceptación de datos provenientes de fuentes de texto y minería de datos programáticamente extraídos de textos o imágenes en patentes o literatura científica.
Filtros Automatizados y Curación de la Información
Revisar manualmente cada uno de los 65 millones de registros en ChemSpider tomaría a una persona más de 600 años trabajando sin descanso, incluso si se dedicaran solo cinco minutos por registro. ChemSpider está gestionada por un pequeño equipo de curadores a tiempo completo, que trabajan para añadir nuevos compuestos, corregir errores y responder a los comentarios de los usuarios. El personal tiene una vasta experiencia en datos químicos y química práctica, con antecedentes en campos como la síntesis orgánica y la conservación de arte, así como una considerable experiencia trabajando en otras bases de datos de la Royal Society of Chemistry, como The Merck Index* Online y Analytical Abstracts.
Revisión por Parte de la Comunidad
Dado que no es posible para los curadores revisar todos los registros, ChemSpider permite y fomenta la participación de sus usuarios para mejorar la base de datos. La forma más sencilla de contribuir es dejando un comentario o enviando un correo electrónico cuando se detecte un error.
Para aquellos usuarios que deseen involucrarse más, ChemSpider permite depositar directamente estructuras y curar sinónimos relacionados con su investigación o trabajo, sin necesidad de enviar un correo electrónico al equipo. Esta colaboración abierta contribuye significativamente a la calidad y precisión de la información disponible en ChemSpider.
Para más información, visite ChemSpider.
